オープンキャンパス & 先週の輪読

7/27(土)には茨城大学オープンキャンパスが開催されました.今年度は水戸,日立,阿見の 3 キャンパス同時開催で,阿見キャンパス会場にも 1000 名以上の来場者があったようです.生物制御化学研究室でも研究室を公開し,戸嶋浩明先生の模擬授業「農学における有機化学」も開講されました.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2431. Sun, B. et al. (2023). A novel transcriptional repressor complex MYB22–TOPLESS–HDAC1 promotes rice resistance to brown planthopper by repressing F3′H expression. New Phytol. 239: 720–738.
2432. Chang, W. et al. (2023). Comparative metabolomics combined with physiological analysis revealed cadmium tolerance mechanism in indica rice (Oryza sativa L.). J. Agric. Food Chem. 71: 7669–7678.
2433. Decsi, K. et al. (2023). Natural immunity stimulation using ELICE16INDURES® plant conditioner in field culture of soybean. Heliyon 9: e12907.
2434. Guillotin, B. et al. (2023). A pan-grass transcriptome reveals patterns of cellular divergence in crops. Nature 617: 785–791.
2435. Ube, N. et al. (2023). Molecular identification of a laccase that catalyzes the oxidative coupling of a hydroxycinnamic acid amide for hordatine biosynthesis in barley. Plant J. 115: 1037–1050.

後期日程入試 & 先週の輪読

3/12(火)には一般選抜後期日程の入学試験が阿見キャンパスでも実施されました.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2355. Rieksta, J. et al. (2023). Volatile responses of dwarf birch to mimicked insect herbivory and experimental warming at two elevations in Greenlandic tundra. Plant-Environ. Interact. 4: 23–35.
2356. Matsuda, H. et al. (2023). Apoplast-localized β-glucosidase elevates isoflavone accumulation in the soybean rhizosphere. Plant Cell Physiol. 64: 486–500.
2357. Nakamori, H., Nunome, M., Takayama, T., Okada, K., and Inoue, K. Isolation of momilactones A and B from rice husk using high-speed countercurrent chromatography. Chromatography in press.
2358. Yildiz, I. et al. (2023). N-Hydroxypipecolic acid induces systemic acquired resistance and transcriptional reprogramming via TGA transcription factors. Plant Cell Environ. 46: 1900–1920.
2359. Hirano, T. et al. (2023). Ab-GALFA, A bioassay for insect gall formation using the model plant Arabidopsis thaliana. Sci Rep. 13: 2554.

前期日程試験 & 今週の輪読

2/25(日)は茨城大学農学部でも一般選抜前期日程と帰国生徒選抜の入学試験が実施されました.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2345. Jiang, B. et al. (2024). Characterization and heterologous reconstitution of Taxus biosynthetic enzymes leading to baccatin III. Science 383: 622–629.
2346. Lacchini, E. et al. (2023). The saponin bomb: a nucleolar-localized β-glucosidase hydrolyzes triterpene saponins in Medicago truncatula. New Phytol. 239: 705–719.
2347. Gross, J.J. et al. (2023). Turnover of benzoxazinoids during the aerobic deterioration of maize silage (Zea mays). J. Agric. Food Chem. 71: 2370–2376.
2348. Gu, B. et al. (2023). A single region of the Phytophthora infestans avirulence effector Avr3b functions in both cell death induction and plant immunity suppression. Mol. Plant Pathol. 24: 317–330.
2349. Zhang, W. et al. (2023). Discovery of a unique flavonoid biosynthesis mechanism in fungi by genome mining. Angew. Chem. Int. Ed. 62: e202215529.

卒業論文発表会 & 今週の輪読

2/19(月)〜21(水)の 3 日間で食生命科学科の卒業論文発表会が開催され,生物制御化学研究室からは 1 名の学生が発表しました.今年度は修論発表会は対面開催されましたが,卒論発表会は Microsoft Teams を用いたオンライン開催で実施されました.オンライン開催だと参加の自由度は高いのですが,やはり個人的には対面でできればその方が良かったような気がしました.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2341. Brugger, A. et al. (2022). Hyperspectral imaging in the UV range allows for differentiation of sugar beet diseases based on changes in secondary plant metabolites. Phytopathology 113: 44–54.
2342. Liu, L. et al. (2023). Isolation and characterization of SPOTTED LEAF42 encoding a porphobilinogen deaminase in rice. Plants 12: 403.
2343. Liu, J. et al. (2024). The phenylalanine ammonia-lyase inhibitor AIP induces rice defence against the root-knot nematode Meloidogyne graminicola. Mol. Plant Pathol. 25: e13424.
2344. Hu, J., Li, L., He, Y., Hong, G., and Zhang, C. (2024). Searching for the virulence-contributing genes of the Magnaporthe oryzae by transcriptome analysis. Pathogens 13: 105.

修士論文発表会 & 今週の輪読

2/15(木),16(金)の二日間で実践農食科学コース(生物制御化学研究室が所属する大学院のコース)の修士論文発表会が開催されました.今年度は新型コロナウイルス感染症の問題が発生する前の 2019 年以来の対面開催で行われました.生物制御化学研究室は今年度は M2 学生がいませんので,発表はありませんでした.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2338. Cai, W. et al. (2023). A receptor-like kinase controls the amplitude of secondary cell wall synthesis in rice. Curr. Biol. 33: 498–506.e6.
2339. Hu, X.-H. et al. (2023). A natural allele of proteasome maturation factor improves rice resistance to multiple pathogens. Nat. Plants 9: 228–237.
2340. Lorensen, M.D.B.B., Hayat, S.Y., Wellner, N., Bjarnholt, N., and Janfelt, C. (2023). Leaves of Cannabis sativa and their trichomes studied by DESI and MALDI mass spectrometry imaging for their contents of cannabinoids and flavonoids. Phytochem. Anal. 34: 269–279.

大学入学共通テスト & 1/9〜19の輪読

1/1314 には茨城大学阿見キャンパスでも大学入学共通テストが開催されました.初日の午後には雪がちらつく天候でしたが,幸い交通機関などに大きな混乱もなく,おおむね順調だったと思います.

1/919の輪読では下記の論文を取り上げました.
2314. Zhang, H. et al. (2022). ZmRop1 participates in maize defense response to the damage of Spodoptera frugiperda larvae through mediating ROS and soluble phenol production. Plant Direct 6: e468.
2315. Yoshida, Y., Nosaka-T, M., Yoshikawa, T., and Sato, Y. (2022). Measurements of antibacterial activity of seed crude extracts in cultivated rice and wild Oryza species. Rice 15: 63.
2316. Liu, C. et al. (2022). Novel plant growth regulator guvermectin from plant growth-promoting rhizobacteria boosts biomass and grain yield in rice. J. Agric. Food Chem. 70: 16229–16240.
2317. Sheng, Q. et al. (2022). Naringenin microsphere as a novel adjuvant reverses colistin resistance via various strategies against multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae infection. J. Agric. Food Chem. 70: 16201–16217.
2318. Pandeya, D., Campbell, L.M., Puckhaber, L., Suh, C., and Rathore, K.S. (2022). Gossypol and related compounds are produced and accumulate in the aboveground parts of the cotton plant, independent of roots as the source. Planta 257: 21.
2319. Zhao, X.-H. et al. (2023). Asymmetric divergent synthesis of ent-kaurane-, ent-atisane-, ent-beyerane-, ent-trachylobane-, and ent-gibberellane-type diterpenoids. J. Am. Chem. Soc. 145: 311–321.
2320Giraldo-Acosta, M. et al. (2023). Protective effect (safener) of melatonin on Vigna radiata L. seedlings in the presence of the fungicide copper oxychloride. J. Plant Growth Regul. 42: 4918–4934.
2321. Bernal, J.S. et al. (2022). Root volatile profiles and herbivore preference are mediated by maize domestication, geographic spread, and modern breeding. Planta 257: 24.
2322. Ma, J., Morel, J.-B., Riemann, M., and Nick, P. (2022). Jasmonic acid contributes to rice resistance against Magnaporthe oryzae. BMC Plant Biol. 22: 601.

卒業式・修了式

本日,令和 4 年度茨城大学卒業式・入学式が挙行されました.茨城県武道館で午前・午後の二部制で開催され,農学部・農学研究科の卒業・修了生は午前の第一部に参加したようです.午後には阿見キャンパスで学位記授与式が行われ,卒業・修了生は宮口農学部長から学位記を授与されました.

生物制御化学研究室では,修士課程修了生 1 名,学部卒業生 1 名です.二人とも進学はしませんので,研究室を離れて 4 月からは新社会人(たまたま今年は二人とも公務員)になります.大学生活や研究室での修論・卒論研究の経験を活かして,社会人としても大いに活躍してくれることを期待しています.

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卒業式当日朝の大学前の県道の桜

修士論文・卒業論文発表会,今週の輪読

生物制御化学研究室が所属している農学専攻実践農食科学コースの修士論文発表会が 2/14, 15,食生命科学科の卒業論文発表会が 2/16, 17, 20 に開催されています.他のコースや学科では今年度は対面で実施しているところもあるようなのですが,我々のコース・学科は今年度もオンラインでの実施です.

生物制御化学研究室の修士の学生さん
1 名は 2/144 年生 1 名は 2/17 に立派に発表することができました.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.

2146. De La Peña, R. et al. (2023). Complex scaffold remodeling in plant triterpene biosynthesis. Science 379: 361–368.
2147. Steinbrenner, A.D. et al. (2022). Signatures of plant defense response specificity mediated by herbivore-associated molecular patterns in legumes. Plant J. 110: 1255–1270.
2148. Schulman, P. et al. (2021). A microbial fermentation product induces defense-related transcriptional changes and the accumulation of phenolic compounds in Glycine max. Phytopathology 112: 862–871.
2149. Bettgenhaeuser, J. et al. (2021). The barley immune receptor Mla recognizes multiple pathogens and contributes to host range dynamics. Nat. Commun. 12: 6915.

共通テスト & 先週の輪読

1/14, 15 には茨城大学農学部でも大学入学共通テストが実施されました.時折小雨が降る不安定な天気でしたが,幸いこの時期にしては暖かな日で雪や路面凍結のような問題は発生しませんでした.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2130. Ozber, N., and Facchini, P.J. (2022). Phloem-specific localization of benzylisoquinoline alkaloid metabolism in opium poppy. J. Plant Physiol. 271: 153641.
2131. Sánchez-Sanuy, F. et al. (2022). Iron induces resistance against the rice blast fungus Magnaporthe oryzae through potentiation of immune responses. Rice 15: 68.
2132. Sonawane, P.D. et al. (2022). 2-Oxoglutarate-dependent dioxygenases drive expansion of steroidal alkaloid structural diversity in the genus Solanum. New Phytol. 234: 1394–1410.

鍬耕祭,研究室セミナー,今週の輪読

10/22, 23 には茨城大学農学部の学園祭である鍬耕祭が 3 年ぶりに開催されました.新型コロナウイルス感染症の影響で二年間開催できなかったため,今回の開催はかなり大変だったと思いますが,実行委員をはじめとした学生たちの頑張りのおかげでなかなか盛況であったようです.秋のミニミニオープンキャンパスとして学部説明会や模擬授業も行われ,長谷川は広報委員長として学部説明を担当しました.鍬耕祭の様子は茨大広報学生プロジェクトの記事がこちらに掲載されています.

今週の研究室セミナーでは化学生態学研究室 4 年生が下記の論文を紹介しました.
Zheng, Y. et al. (2021). Auxin guides germ-cell specification in Arabidopsis anthers. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 118: e2101492118.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.

2097. Yin, X. et al. (2022). Cinnamoyl CoA: NADP oxidoreductase-like 1 regulates abscisic acid response by modulating phaseic acid homeostasis in Arabidopsis thaliana. J. Exp. Bot. 73: 860–872.
2098. Qian, B. et al. (2022). MoErv29 promotes apoplastic effector secretion contributing to virulence of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae. New Phytol. 233: 1289–1302.
2099. Ampt, E.A. et al. (2022). Plant neighbours can make or break the disease transmission chain of a fungal root pathogen. New Phytol. 233: 1303–1316.
2100. Zhai, K. et al. (2022). NLRs guard metabolism to coordinate pattern- and effector-triggered immunity. Nature 601: 245–251.

オープンキャンパス,研究室セミナー,先週の輪読

7/23(土)には茨城大学オープンキャンパスが開催されました.阿見キャンパス会場にも多くの高校生や保護者の皆さんが来訪されました.過去 2 年間は新型コロナウイルス感染症の影響で,来場型のオープンキャンパスを開催することができませんでしたが,今年度は感染拡大の中ではありましたが,なんとか開催することができました.長谷川は農学部広報委員長という立場でしたので,学部全体に関わる業務を担当していましたが,研究室公開は戸嶋先生と研究室の学生さんに担当してもらって,30 名程度の訪問があったようです.

先週の研究室セミナーでは化学生態学研究室 4 年生の学生が下記の論文を紹介しました.
Zhou, Y., Park, S.-H., Soh, M.Y., and Chua, N.-H. (2021). Ubiquitin-specific proteases UBP12 and UBP13 promote shade avoidance response by enhancing PIF7 stability. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 118: e2103633118.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2052. Ding, Y. et al. (2021). Adaptive defence and sensing responses of host plant roots to fungal pathogen attack revealed by transcriptome and metabolome analyses. Plant Cell Environ. 44: 3756–3774.
2053. Tzipilevich, E., Russ, D., Dangl, J.L., and Benfey, P.N. (2021). Plant immune system activation is necessary for efficient root colonization by auxin-secreting beneficial bacteria. Cell Host Microbe 29: 1507–1520.e4.
2054. Nißler, R. et al. (2022). Detection and imaging of the plant pathogen response by near-infrared fluorescent polyphenol sensors. Angew. Chem. Int. Ed. 61: e202108373.

一年次生阿見オリエンテーション,研究室セミナー,先週の輪読

茨城大学農学部は阿見キャンパスにありますが,一年次生は本部のある水戸キャンパスで勉強しています.二年次生以降で主な学生生活を送ることになる阿見キャンパスを訪問する阿見キャンパスオリエンテーションが毎年一年次生向けの授業科目「大学入門ゼミ」の一環として行われています.今年度は 6/12(日)に開催されました.研究室見学は阿見オリエンテーションのメインイベントになっていますので,生物制御化学研究室にも見学に来ていました.

先週の研究室セミナーでは化学生態学研究室修士 2 年生の学生が下記の論文を紹介しました.
Dixit, S. et al. β-Cyanoalanine synthase protects mites against Arabidopsis defenses. Plant Physiol. in press.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2032. Li, R., Zhang, J., Li, Z., Peters, R.J., and Yang, B. (2022). Dissecting the labdane-related diterpenoid biosynthetic gene clusters in rice reveals directional cross-cluster phytotoxicity. New Phytol. 233: 878–889.
2033. Shinya, T. et al. Chitooligosaccharide elicitor and oxylipins synergistically elevate phytoalexin production in rice. Plant Mol. Biol. in press.
2034. Yan, N. et al. (2022). Chromosome-level genome assembly of Zizania latifolia provides insights into its seed shattering and phytocassane biosynthesis. Commun. Biol. 5: 36.

卒業式

今年度の茨城大学卒業式・修了式は 3/23(水)に茨城県武道館と水戸キャンパス講堂で二部に分けて開催されました.昨年と一昨年は武道館に卒業生が集合する卒業式はできませんでしたが,今年度は制限のある中でも何とか開催することができ良かったと思います.農学部・農学研究科の卒業・修了生には午後阿見キャンパスで学部長・研究科長の戸嶋先生から各自に学位記が手渡されました.状況から仕方ないことですが,残念ながら謝恩会は 3 年連続で開催されませんでした.
生物制御化学研究室からは学部生 3 名が卒業(うち 1 名が修士進学予定),修士課程学生 1 名が修了しました.

後期日程入試 & 今週の輪読

3/12(土)には一般選抜(後期日程)の入学試験が実施されました.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.
2000. Kong, Y. et al. (2021). OsPHR2 modulates phosphate starvation-induced OsMYC2 signaling and resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Plant Cell Environ. 44: 3432–3444.
2001. Fang, X. et al. (2021). HSP17.4 mediates salicylic acid and jasmonic acid pathways in the regulation of resistance to Colletotrichum gloeosporioides in strawberry. Mol. Plant Pathol. 22: 817–828.
2002. El Houari, I. et al. (2021). Seedling developmental defects upon blocking CINNAMATE-4-HYDROXYLASE are caused by perturbations in auxin transport. New Phytol. 230: 2275–2291.
2003. Sikder, M.M. et al. (2021). Benzoxazinoids selectively affect maize root-associated nematode taxa. J. Exp. Bot. 72: 3835–3845.
2004. Perez, V.C. et al. (2021). Aldoximes are precursors of auxins in Arabidopsis and maize. New Phytol. 231: 1449–1461.

前期日程入試 & 先週の輪読

2/25(金)には一般選抜(前期日程)入学試験が茨城大学農学部でも実施されました.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.
1992. Zhang, Z. et al. (2021). Chemical identity and functional characterization of semiochemicals that promote the interactions between rice plant and rice major pest Nilaparvata lugens. J. Agric. Food Chem. 69: 4635–4644.
1993. Yildiz, I. et al. (2021). The mobile SAR signal N-hydroxypipecolic acid induces NPR1-dependent transcriptional reprogramming and immune priming. Plant Physiol. 186: 1679–1705.
1994. Cao, Y. et al. (2021). OsPG1 encodes a polygalacturonase that determines cell wall architecture and affects resistance to bacterial blight pathogen in rice. Rice 14: 36.

修士論文・卒業論文発表会 & 今週の輪読

2/15, 16 には生物制御化学研究室が所属している実践農食科学コースの修士論文発表会がオンラインで開催されました.本研究室からは鳥井潤一郎君が「ホウレンソウのフラボノイド型ファイトアレキシンの同定」というタイトルで発表しました.今回発表した学生たちは修士課程の二年間がほぼ丸々新型コロナウイルス感染症発生時期と重なって,いつもとは違う苦労が多い大学院生活になってしまいましたが,皆さん立派に発表することができていました.

続いて 2/17 からは食生命科学科の卒業論文発表会が同様にオンラインで始まりました.こちらは来週月曜日までかかり,生物制御化学研究室の学生たちの発表は来週月曜日の予定です.

今週の輪読では下記の論文を取り上げました.
1987. Yang, C. et al. (2021). Poaceae-specific cell wall-derived oligosaccharides activate plant immunity via OsCERK1 during Magnaporthe oryzae infection in rice. Nat. Commun. 12: 2178.
1988. Michell, C.T., and Nyman, T. Microbiomes of willow-galling sawflies: effects of host plant, gall type, and phylogeny on community structure and function. Genome in press.
1989. Xia, J. et al. (2021). Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins. Cell 184: 1693–1705.e17.
1990. Tsuzuki, C. et al. An amino acid ester of menthol elicits defense responses in plants. Plant Mol. Biol. in press.
1991. Chang, X. et al. Virus-induced plant volatiles mediate the olfactory behaviour of its insect vectors. Plant Cell Environ. in press.

大学入学共通テスト & 先週の輪読

1/15, 16 には茨城大学阿見キャンパスでも大学入学共通テストが実施されました.

先週の輪読では下記の論文を取り上げました.

1965. Zhou, X. et al. (2021). Membrane receptor-mediated mechano-transduction maintains cell integrity during pollen tube growth within the pistil. Dev. Cell 56: 1030–1042.e6.
1966. Jarzyniak, K. et al. (2021). Early stages of legume-rhizobia symbiosis are controlled by ABCG-mediated transport of active cytokinins. Nat. Plants 7: 428–436.
1967. Chen, R. et al. (2021). Discovery and modulation of diterpenoid metabolism improves glandular trichome formation, artemisinin production and stress resilience in Artemisia annua. New Phytol. 230: 2387–2403.
1968. Shen, S. et al. (2021). An Oryza-specific hydroxycinnamoyl tyramine gene cluster contributes to enhanced disease resistance. Sci. Bull. 66: 2369–2380.

1 年次生阿見オリエンテーション

茨城大学農学部の 1 年次生は普段の授業は水戸キャンパスで受講していますが,一年に一回だけ阿見オリエンテーションという阿見キャンパスの見学会があります(授業の一環です).昨年度は新型コロナウイルス感染症の影響で 11 月の実施になってしまいましたが,例年 6 月ごろに実施されていて,今年度は今日水戸から 1 年生が阿見キャンパスに来ました.午後には研究室見学もあり,生物制御化学研究室には事前に割り当てられた 2 班の見学がありました.